Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C8orf4Q9NR00 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms