Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRMS1Q9HCU9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms