Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LY9Q9HBG7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LY9Q9HBG7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms