Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms