Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLSTN2Q9H4D0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms