Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EHD4Q9H223 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHD4Q9H223 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms