Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K4

RSPH6A, Radial spoke head protein 6 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH6AQ9H0K4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RSPH6AQ9H0K4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RSPH6AQ9H0K4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms