Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTNAP4Q9C0A0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNTNAP4Q9C0A0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms