Protein–RNA interactions for Protein: Q9C056

NKX6-2, Homeobox protein Nkx-6.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX6-2Q9C056 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX6-2Q9C056 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms