Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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NDUFAF3Q9BU61 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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NDUFAF3Q9BU61 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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NDUFAF3Q9BU61 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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NDUFAF3Q9BU61 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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NDUFAF3Q9BU61 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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NDUFAF3Q9BU61 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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NDUFAF3Q9BU61 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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NDUFAF3Q9BU61 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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NDUFAF3Q9BU61 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFAF3Q9BU61 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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