Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms