Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RGPD5Q99666 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms