Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SIN3AQ96ST3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms