Protein–RNA interactions for Protein: Q96S16

JMJD8, JmjC domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD8Q96S16 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
JMJD8Q96S16 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms