Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms