Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEUROD6Q96NK8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEUROD6Q96NK8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms