Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms