Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DCHS1Q96JQ0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms