Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms