Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BCANQ96GW7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms