Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms