Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF428Q96B54 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms