Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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