Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAAF4Q8WXU2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAAF4Q8WXU2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms