Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSMEM1Q8WWF3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.5 ms