Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
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FAT3Q8TDW7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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FAT3Q8TDW7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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FAT3Q8TDW7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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FAT3Q8TDW7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
FAT3Q8TDW7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
FAT3Q8TDW7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
FAT3Q8TDW7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
FAT3Q8TDW7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
FAT3Q8TDW7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
FAT3Q8TDW7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
FAT3Q8TDW7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
FAT3Q8TDW7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
FAT3Q8TDW7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
FAT3Q8TDW7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
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