Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRSK1Q8TDC3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRSK1Q8TDC3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRSK1Q8TDC3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRSK1Q8TDC3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRSK1Q8TDC3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRSK1Q8TDC3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRSK1Q8TDC3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRSK1Q8TDC3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRSK1Q8TDC3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRSK1Q8TDC3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRSK1Q8TDC3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRSK1Q8TDC3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRSK1Q8TDC3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRSK1Q8TDC3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRSK1Q8TDC3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRSK1Q8TDC3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRSK1Q8TDC3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRSK1Q8TDC3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRSK1Q8TDC3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRSK1Q8TDC3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BRSK1Q8TDC3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRSK1Q8TDC3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRSK1Q8TDC3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRSK1Q8TDC3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRSK1Q8TDC3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRSK1Q8TDC3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRSK1Q8TDC3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRSK1Q8TDC3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BRSK1Q8TDC3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
BRSK1Q8TDC3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRSK1Q8TDC3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms