Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHX4

SPATA3, Spermatogenesis-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA3Q8NHX4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPATA3Q8NHX4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPATA3Q8NHX4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPATA3Q8NHX4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPATA3Q8NHX4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPATA3Q8NHX4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPATA3Q8NHX4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPATA3Q8NHX4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPATA3Q8NHX4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPATA3Q8NHX4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPATA3Q8NHX4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPATA3Q8NHX4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPATA3Q8NHX4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPATA3Q8NHX4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPATA3Q8NHX4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPATA3Q8NHX4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPATA3Q8NHX4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPATA3Q8NHX4 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPATA3Q8NHX4 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPATA3Q8NHX4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPATA3Q8NHX4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPATA3Q8NHX4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPATA3Q8NHX4 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPATA3Q8NHX4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPATA3Q8NHX4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms