Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C17orf47Q8NEP4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms