Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AVL9Q8NBF6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms