Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z2

CCDC71L, Coiled-coil domain-containing protein 71L, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71LQ8N9Z2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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