Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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CLDN19Q8N6F1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLDN19Q8N6F1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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