Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC2Q8N158 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms