Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms