Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6W1

TMCO2, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO2Q7Z6W1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCO2Q7Z6W1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMCO2Q7Z6W1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMCO2Q7Z6W1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMCO2Q7Z6W1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMCO2Q7Z6W1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMCO2Q7Z6W1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMCO2Q7Z6W1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMCO2Q7Z6W1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMCO2Q7Z6W1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TMCO2Q7Z6W1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TMCO2Q7Z6W1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TMCO2Q7Z6W1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TMCO2Q7Z6W1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TMCO2Q7Z6W1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TMCO2Q7Z6W1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMCO2Q7Z6W1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMCO2Q7Z6W1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TMCO2Q7Z6W1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMCO2Q7Z6W1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMCO2Q7Z6W1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMCO2Q7Z6W1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMCO2Q7Z6W1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMCO2Q7Z6W1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMCO2Q7Z6W1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMCO2Q7Z6W1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMCO2Q7Z6W1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMCO2Q7Z6W1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms