Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY3Q7L099 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms