Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PREX2Q70Z35 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PREX2Q70Z35 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms