Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP31Q70CQ4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
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