Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms