Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP47Q6ZTR5 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP47Q6ZTR5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP47Q6ZTR5 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP47Q6ZTR5 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP47Q6ZTR5 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP47Q6ZTR5 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP47Q6ZTR5 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP47Q6ZTR5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP47Q6ZTR5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP47Q6ZTR5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP47Q6ZTR5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP47Q6ZTR5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP47Q6ZTR5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP47Q6ZTR5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP47Q6ZTR5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP47Q6ZTR5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP47Q6ZTR5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP47Q6ZTR5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP47Q6ZTR5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP47Q6ZTR5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP47Q6ZTR5 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP47Q6ZTR5 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP47Q6ZTR5 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP47Q6ZTR5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP47Q6ZTR5 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP47Q6ZTR5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP47Q6ZTR5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP47Q6ZTR5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP47Q6ZTR5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP47Q6ZTR5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CFAP47Q6ZTR5 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms