Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FAM43BQ6ZT52 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM43BQ6ZT52 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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