Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCSD1Q6JBY9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms