Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01545Q5VT33 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms