Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GKAP1Q5VSY0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms