Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q5VSD8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q5VSD8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q5VSD8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q5VSD8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q5VSD8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q5VSD8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q5VSD8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q5VSD8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q5VSD8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q5VSD8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q5VSD8 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q5VSD8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q5VSD8 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q5VSD8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q5VSD8 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q5VSD8 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q5VSD8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q5VSD8 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q5VSD8 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q5VSD8 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q5VSD8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q5VSD8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q5VSD8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q5VSD8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q5VSD8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q5VSD8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q5VSD8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q5VSD8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q5VSD8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q5VSD8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q5VSD8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q5VSD8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q5VSD8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q5VSD8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q5VSD8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q5VSD8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q5VSD8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q5VSD8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q5VSD8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q5VSD8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q5VSD8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q5VSD8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q5VSD8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q5VSD8 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q5VSD8 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q5VSD8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q5VSD8 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q5VSD8 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q5VSD8 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q5VSD8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms