Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RSPH4AQ5TD94 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms