Protein–RNA interactions for Protein: Q5PRF9

SAMD4B, Protein Smaug homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4BQ5PRF9 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
SAMD4BQ5PRF9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD4BQ5PRF9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms