Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COLEC12Q5KU26 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms