Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms