Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNT1Q5JUK3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms